Im Mai 2006 startete das Büro am Fluss das Projekt „Lebendige Weser“ mit einem Weser-Etappen-Marathon von der Quelle bis zur Mündung. Die so genannte „Tour de Weser“ stellt die symbolische Vernetzung entlang des Flusses und gleichzeitig deutet Sie auf den Anspruch der Initiatoren ein kreatives Miteinander für Mensch und Natur zu erreichen. 450 Kilometer Strecke, insgesamt 13 Tage unterwegs, die Beteiligung von fast 300 Läuferinnen und Läufer, die über 2200 Kilometer zurücklegten, die Besichtigung von einigen interessanten Projekten und eine Vielzahl von persönlichen Kontakten zu Menschen, die sich für die Weser interessieren und aktiv einsetzen, ist eine positive Bilanz und Resonanz. Zudem konnte politisch ein Zeichen für die Weser gesetzt werden. Dazu wurden die Unterschriften vieler Bürgervertreter der Anrainerstädte auf ein T-Shirt für Bundesumweltminister Gabriel gesammelt und persönlich, jedoch mit der Bahn, nach Berlin gebracht. Mit diesem Auftakt wurde ein Grundstein gelegt, Menschen das Gewässer und den Lebensraum Weser wieder näher zu bringen.